1 180 dessins de systèmes racinaires de plantes

 (images.wur.nl)
3 points par GN⁺ 2024-04-09 | 1 commentaires | Partager sur WhatsApp
  • La collection numérique de Wageningen University & Research permet de parcourir 1 180 dessins de racines de plantes, par espèce et par recueil
  • Les ressources sont réparties en sous-ensembles : plantes de prairies d’Europe centrale, adventices des champs et plantes cultivées, racines de plantes de divers habitats, arbres et arbustes forestiers, plantes cultivées tempérées, etc.
  • La liste affiche actuellement les enregistrements 1 à 100, et l’exploration complète s’étend sur 12 pages
  • Les éléments de la première page sont organisés principalement autour des noms scientifiques des plantes, comme Abies alba, Acer pseudoplatanus, Allium cepa, Alnus glutinosa ou Arabidopsis thaliana
  • Un même nom scientifique apparaît plusieurs fois, ce qui indique l’existence de plusieurs dessins ou enregistrements pour une même espèce

Exploration de la collection Root System Drawings

  • La collection numérique de Wageningen University & Research permet d’explorer la collection Root System Drawings
  • Elle compte 1 180 enregistrements au total, et l’écran actuel indique Records 1-100 of 1,180
  • Dans la pagination, la page 1 est actuellement sélectionnée, puis viennent les pages 2, 3, …, jusqu’à 12

Volume par sous-collection

Exemples d’éléments de la première page

Enregistrements répétés et mode d’exploration

  • Certains noms scientifiques apparaissent dans plusieurs enregistrements
    • Abies alba apparaît dans les trois premiers enregistrements
    • Acer pseudoplatanus apparaît dans les enregistrements 7 à 9
    • Alnus glutinosa apparaît dans les enregistrements 52 à 54
  • La liste comprend une interface de navigation permettant d’ajuster le tri et le nombre de résultats par page

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1 commentaires

 
GN⁺ 2024-04-09
Commentaires sur Hacker News
  • Vraiment fascinant et superbe. Si vous jardinez, on peut y chercher le système racinaire des plantes courantes et des mauvaises herbes
    liseron : https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/193/rec/1 le gros rhizome blanc se trouve à environ 10 cm de profondeur, mais les vraies racines descendent bien plus bas, cet exemple allant jusqu’à 2,2 m
    prêle : https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/753/rec/1 elle fait aussi des racines profondes, est très coriace, résiste à de nombreux herbicides et peut aussi se propager par spores
    pas le chrysanthème trifolié mais la goutweed : https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/1435/rec/... de fines racines forment un maillage dense
    pissenlit : https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/676/rec/2 dans cet exemple, les racines atteignent 4,5 m
    pomme de terre : https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/1014/rec/... trouvée à la place de la tomate que je cherchais, mais comme c’est le même genre, c’est utile comme référence, et on voit aussi les tubercules
    carotte : https://images.wur.nl/digital/collection/coll13/id/1049/rec/... il n’y a pas que la racine pivotante comestible
    • Impossible d’oublier le dessin du liseron après l’avoir vu. On comprend tout de suite pourquoi il faut autant de temps pour le maîtriser
    • Cela pourrait être utile pour comprendre à quel point les plantes sont compatibles sous terre. Par exemple, le pissenlit semble assez inoffensif, alors que la goutweed ne laisse presque aucune place aux autres plantes
    • Une racine de pissenlit de 450 cm, voilà qui explique pourquoi arracher les jeunes pousses ne suffit pas à empêcher leur retour
  • J’ai vu ce travail colossal mené par Herr Dipl.-Ing Dr. Erwin Lichtenegger de 1960 à 2009. Pendant un temps, j’ai voulu convertir tout cela en format 3D, mais je n’ai eu de réponse ni de la bibliothèque ni du Pflanzensoziologisches Institute
    Ce serait formidable sous forme d’animation, et je me demande quel travail d’archivage cet excellent docteur aurait pu accomplir avec les outils d’aujourd’hui
    Des efforts et une telle persévérance sur une aussi longue durée sont rares, et je suis heureux que cela soit si bien conservé, à la fois comme science et comme œuvre d’art
    Au passage, le cahier des neurones cérébraux du Dr Santiago Ramon y Cajal est lui aussi digne d’un musée et, vu de loin, présente des similitudes étonnantes avec ces racines
    • C’est dommage que le livre coûte plus de 200 euros
  • Le nombre de chiffres significatifs dans le titre me fait souffrir. On dirait qu’ils ont délibérément essayé de brouiller le dernier chiffre
    Ils auraient dû soit écrire le nombre entier 1,18x, soit arrondir à la centaine et mettre 1.2k
    • 1.18k contient plus de caractères que 1180. Qui a fait ce titre ?
    • Au début, il y avait 1 030 dessins, donc le titre était 1k. Puis 110 ont été ajoutés et il a fallu changer le titre, qui est devenu 1.1k
      Ensuite 42 ont été ajoutés, il a donc encore fallu changer le titre, cette fois en 1.18k
      Dans deux semaines, 6 autres seront ajoutés, il faudra donc encore changer le titre, et on pourra le republier en 1.188k
  • Si vous voulez voir des fruits, il y a aussi la USDA Pomological Collection
    https://search.nal.usda.gov/discovery/collectionDiscovery?vi...
  • Comment ces dessins ont-ils été réalisés ? Pour être précis, il semble qu’il faille déblayer avec précaution la terre autour des racines, par tout petits morceaux, afin d’enregistrer la forme réelle du système racinaire avant qu’il ne soit perturbé
    Il aurait ensuite fallu observer lentement des couches superficielles jusqu’aux couches profondes, puis reconstituer la vue de profil visible sur le dessin
    Si l’on faisait pousser la plante dans une sorte de récipient d’observation en verre 2D pour voir les racines de côté, il y a de fortes chances qu’elles poussent différemment des conditions naturelles
    Je suis très curieux de savoir comment ils ont réellement procédé
  • Ce qui est drôle, c’est que 1.18k contient plus de caractères que 1180, et qu’en général la notation en k donne l’impression d’être utilisée pour une valeur moins précise, comme 1k
    • En électrotechnique, ce problème n’existe pas. Il suffit d’écrire 1k18
    • 1.18k implique ±5, alors que 1180 signifie exactement 1180. Le nombre n’est peut-être pas exact, ou alors il continue d’évoluer
  • C’est donc pour ça que les gens pensent que l’analyse des causes profondes consiste à trouver une seule cause racine
  • C’est vraiment superbe et très instructif. Il y a toutefois une mise en garde importante. La façon dont les racines poussent réellement dépend fortement du sol
    Sable ou argile, humidité, et surtout présence ou emplacement de couches compactées ont un impact majeur
    Beaucoup de systèmes racinaires sont tout simplement incapables de traverser un sol fortement compacté, donc il faut s’attendre à une variabilité considérable
  • Sous certains aspects, cela rappelle la base de données de traçage des cellules neuronales de l’Allen Brain Atlas
    https://celltypes.brain-map.org/data