5 points par GN⁺ 2025-03-13 | Aucun commentaire pour le moment. | Partager sur WhatsApp
  • Présentation des principaux outils de validation des données actuels (en 2025) et recommandations selon les cas d’usage
  • La validation des données consiste à vérifier automatiquement ou semi-automatiquement la qualité des données
    • Vérification des types de données, comptage des valeurs manquantes, détection des valeurs anormales
  • Il est possible de valider non seulement les lignes d’un dataframe, mais aussi les entrées d’API ou les valeurs soumises via des formulaires
  • L’utilisateur peut définir des règles, par exemple qu’une certaine colonne doit contenir des valeurs comprises dans une plage donnée
  • En cas d’échec de validation : il est possible de lever une erreur, de générer un rapport de validation, puis de traiter le problème manuellement ou automatiquement

Pourquoi la validation des données est importante

  • Les travaux d’analyse des organismes publics se divisent en deux grandes catégories :
    • Analyses ad hoc – travaux d’analyse ponctuels
    • Production statistique régulière – collecte et traitement réguliers de nouvelles données
  • Il est nécessaire de valider les données avant que les erreurs n’affectent les résultats d’analyse
  • La validation des données est efficace pour réduire le risque d’erreur et améliorer la précision

Principaux outils de validation des données

1. Great Expectations

  • Outil de validation des données puissant, adapté à un niveau de production

  • Dispose d’un package open source et propose également un service cloud payant

  • Offre des fonctionnalités avancées :

    • automatisation possible, par exemple l’envoi de messages Slack en cas d’échec de validation
  • La configuration est complexe et nécessite souvent des compétences en data science

  • Exemple de code :

    import great_expectations as gx  
    import pandas as pd  
    
    context = gx.get_context()  
    df = pd.read_csv("https://raw.githubusercontent.com/great-expectations/gx_tutorials/…;)  
    
    data_source = context.data_sources.add_pandas("pandas")  
    data_asset = data_source.add_dataframe_asset(name="pd dataframe asset")  
    batch_definition = data_asset.add_batch_definition_whole_dataframe("batch definition")  
    batch = batch_definition.get_batch(batch_parameters={"dataframe": df})  
    
    # Vérifier que les valeurs sont comprises entre 1 et 6  
    expectation = gx.expectations.ExpectColumnValuesToBeBetween(column="passenger_count", min_value=1, max_value=6)  
    validation_result = batch.validate(expectation)  
    

    Exemple de configuration d’une alerte Slack en cas d’échec de validation :

    from gx.actions import SlackNotificationAction, UpdateDataDocsAction  
    
    action_list = [  
        SlackNotificationAction(  
            name="send_slack_notification_on_failed_expectations",  
            slack_token="${validation_notification_slack_webhook}",  
            slack_channel="${validation_notification_slack_channel}",  
            notify_on="failure",  
            show_failed_expectations=True,  
        ),  
        UpdateDataDocsAction(name="update_all_data_docs"),  
    ]  
    

2. Pointblank

  • Outil de validation des données Python récent, lancé en 2024 (créé par RStudio → Posit)
  • Influencé par Great Expectations et propose une syntaxe intuitive
  • Prend en charge diverses sources de données comme Polars, Pandas et DuckDB
  • Exemple de code :
    import pointblank as pb  
    
    validation = (  
        pb.Validate(data=pb.load_dataset(dataset="small_table"))  
        .col_vals_gt(columns="d", value=100)  
        .col_vals_le(columns="c", value=5)  
        .col_exists(columns=["date", "date_time"])  
        .interrogate()  
    )  
    
  • Manque de fonctionnalités d’automatisation des actions de suivi → les actions ultérieures doivent être traitées manuellement

3. Pandera

  • Propose une API similaire à Great Expectations

  • Prend en charge les tests d’hypothèse statistiques

  • Prend en charge diverses sources de données comme Polars, Geopandas et Pyspark

  • Exemple de code :

    import pandas as pd  
    import pandera as pa  
    
    df = pd.DataFrame({  
        "column1": [1, 4, 0, 10, 9],  
        "column2": [-1.3, -1.4, -2.9, -10.1, -20.4],  
        "column3": ["value_1", "value_2", "value_3", "value_2", "value_1"],  
    })  
    
    schema = pa.DataFrameSchema({  
        "column1": pa.Column(int, checks=pa.Check.le(10)),  
        "column2": pa.Column(float, checks=pa.Check.lt(-1.2)),  
        "column3": pa.Column(str, checks=[  
            pa.Check.str_startswith("value_"),  
            pa.Check(lambda s: s.str.split("_", expand=True).shape[1] == 2)  
        ]),  
    })  
    
    validated_df = schema(df)  
    
  • Exemple de test d’hypothèse statistique :

    from scipy import stats  
    
    schema = pa.DataFrameSchema({  
        "height_in_feet": pa.Column(float, [  
            pa.Hypothesis.two_sample_ttest(  
                sample1="M",  
                sample2="F",  
                groupby="sex",  
                relationship="greater_than",  
                alpha=0.05,  
                equal_var=True  
            )  
        ]),  
        "sex": pa.Column(str)  
    })  
    
    schema.validate(df)  
    

4. Pydantic

  • Outil de validation fondé sur des dictionnaires, et non sur des dataframes
  • Adapté à la validation de données JSON et non structurées
  • Peut s’intégrer à des frameworks d’API comme FastAPI
  • Exemple de code :
    from pydantic import BaseModel, PositiveInt  
    from datetime import datetime  
    
    class User(BaseModel):  
        id: int  
        name: str = 'John Doe'  
        signup_ts: datetime | None  
        tastes: dict[str, PositiveInt]  
    
    external_data = {  
        'id': 123,  
        'signup_ts': '2019-06-01 12:22',  
        'tastes': {'wine': 9, 'cheese': 7, 'cabbage': '1'}  
    }  
    
    user = User(**external_data)  
    

5. Cerberus

  • Outil de validation fondé sur des dictionnaires
  • Configuration simple basée sur des règles
  • Retourne une valeur True/False → ne lève pas d’erreur
  • Exemple de code :
    from cerberus import Validator  
    
    schema = {'name': {'type': 'string'}}  
    v = Validator(schema)  
    document = {'name': 'john doe'}  
    v.validate(document)  
    # True  
    

6. jsonschema

  • Outil de validation pour les données JSON
  • Définition fondée sur un schéma
  • Exemple de code :
    from jsonschema import validate  
    
    schema = {  
        "type": "object",  
        "properties": {  
            "price": {"type": "number"},  
            "name": {"type": "string"}  
        }  
    }  
    
    validate(instance={"name": "Eggs", "price": 34.99}, schema=schema)  
    

Quel outil utiliser dans le secteur public ?

  • Validation de dataframes ou de bases de données :
    • usage en système de production → Great Expectations recommandé
    • validation simple → Pandera recommandé
    • envie d’essayer un outil récent → Pointblank recommandé
  • Validation d’API ou d’entrées utilisateur :
    • données non structurées → Pydantic recommandé
  • Validation JSON simple :
    • jsonschema recommandé
  • Si une validation très simple suffit :
    • Cerberus recommandé

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