« Obelisks » : une nouvelle classe de forme de vie découverte dans le système digestif humain

Une nouvelle classe de forme de vie, les « Obelisks », découverte dans le système digestif humain

• Contexte de l’étude

  • En étudiant les communautés microbiennes présentes à l’intérieur du corps humain, des chercheurs ont découvert un nouveau type d’objet semblable à un virus.
  • Comme ces objets ne présentent ni structure ni séquence similaires aux agents biologiques connus, l’hypothèse d’un nouveau groupe de formes de vie, distinct des virus, a été avancée.

• Caractéristiques des Obelisks

  • Les Obelisks possèdent une structure d’ARN symétrique en forme de bâtonnet, et leur séquence génétique est composée d’environ 1 000 nucléotides.
  • Leur petite taille pourrait expliquer pourquoi ils n’avaient pas été détectés auparavant.
  • L’équipe de recherche a analysé un jeu de données de 5,4 millions de séquences génétiques et identifié environ 30 000 Obelisks différents.
  • Ils ont été détectés dans environ 10 % du microbiote humain et, dans certains jeux de données, dans 50 % des échantillons buccaux de patients.

• Répartition et hôtes des Obelisks

  • Les Obelisks sont présents dans diverses parties du corps humain, et un type d’hôte cellulaire spécifique a été isolé dans le micro-organisme buccal Streptococcus sanguinis.
  • Les hôtes des autres Obelisks restent inconnus, même si certains pourraient être présents chez des bactéries.

• Code génétique et fonction des Obelisks

  • Les Obelisks contiennent des gènes codant un nouveau type de protéine appelé Oblins.
  • Ces protéines pourraient intervenir dans le processus de réplication des Obelisks.
  • Contrairement aux virus à ARN, ils ne possèdent pas de gènes formant une capside protéique, et leur taille est supérieure à celle des plasmides.

• Conclusion de l’étude

  • Les Obelisks pourraient ne pas être des virus et ressembler davantage à des plasmides à ARN.
  • L’étude n’a pas encore fait l’objet d’une évaluation par les pairs et a été prépubliée sur bioRxiv.

[GN⁺]

Avis Hacker News

• En tant que co-auteur, cette étude a été publiée dans Cell

  • Elle s’inscrit dans un programme de recherche mené en collaboration avec l’Université de Toronto ; on peut aussi consulter les articles sur les Virus-Viroid Hybrids et les Zeta-Elements
  • La biologie computationnelle élargit de façon révolutionnaire notre compréhension de la biodiversité sur Terre
  • Je pense que les Zeta-elements, les Ambiviruses et les Obelisks ne sont qu’un début
  • Le laboratoire de recherche sur les formes de vie à base d’ARN recrute des développeurs passionnés, des post-doctorants et des doctorants

• Des chercheurs ont découvert de nouveaux objets semblables à des virus

  • J’étais d’abord perplexe, puis j’ai compris qu’il ne s’agissait pas d’une « class » au sens technique du terme

• Heureux de voir qu’une nouvelle pièce du puzzle sur le fonctionnement de l’intestin a été trouvée

  • Cela pourrait permettre de mieux comprendre l’immunité, les maladies neurodégénératives, le cancer, etc.

• Comme l’étude n’a pas encore été évaluée par les pairs, le titre paraît trop affirmatif par rapport à ce qu’il avance

• La vie est généralement définie par sa capacité à se reproduire, ce qui dépend de la machinerie cellulaire de l’hôte

  • Je me demande s’ils ont une utilité connue, ou s’il s’agit peut-être d’ADN inutile associé d’une manière ou d’une autre

• Découverte stupéfiante et fascinante

• L’article a été écrit en janvier ; je me demande si l’étude n’a été publiée dans une revue que maintenant

• Il pourrait s’agir d’un vestige du monde de l’ARN

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