Lecteur PDF de Google Scholar

[GN⁺]

Avis sur Hacker News

• C’est évident que ça finira par être abandonné, donc je compte déjà les jours. Je me suis trop souvent brûlé les ailes en dépendant de Google ; désormais, les seules choses fiables chez eux sont le pistage et l’injection de publicité, et ils s’améliorent là-dessus chaque jour

  • Le vrai objectif ne serait-il pas de collecter des données d’entraînement sur les parties des articles que les lecteurs jugent importantes, et sur les sujets qui sont liés entre eux ?
  • Google Scholar est aussi beaucoup utilisé en interne, donc même s’il n’a jamais rapporté d’argent à Google, il semble peu probable qu’il soit arrêté
  • Mais mieux vaut l’avoir que ne pas l’avoir, non ?
  • Tout à fait d’accord. Tous les produits Google donnent l’impression d’avoir un compte à rebours de fin de vie attaché
  • Google a travaillé dur pour acquérir cette réputation. Je n’ai plus envie de dépendre d’aucune partie de l’écosystème Google

• Le domaine qui consiste à capturer et visualiser les connaissances issues de la recherche m’intéresse beaucoup personnellement. Le volume de publications continue d’augmenter, les apps de lecture restent encore assez rudimentaires, et les outils de lecture et de prise de notes sont quelque peu séparés, si bien que lire en profondeur et assimiler reste difficile, à mon avis
  Google PDF Reader commence seulement maintenant à traiter le problème de la consultation facile des références, et j’ai créé moi-même une app pour capturer et organiser les connaissances de recherche personnelles, comme des lecteurs construits par-dessus la bibliothèque PDFjs : https://www.knowledgegarden.io/
  En plus, la visualisation et le contexte de notes personnalisable aident à se remémorer les informations et à les relier

  • Zotero ne fait-il pas déjà ça assez bien ?

• Je me demande s’il existe des outils de lecture d’articles scientifiques dont les gens sont satisfaits. Zotero couvre la plupart de mes besoins, mais j’aimerais pouvoir organiser les articles plus rapidement et disposer de meilleurs outils d’annotation. Une aide à la lecture par IA serait aussi appréciable

  • Comme je n’aimais pas la manière dont les gestionnaires de références traitent les annotations, j’ai créé ma propre app : https://getcahier.com
    J’y ai intégré la gestion des surlignages afin d’extraire les passages surlignés par thème, de les organiser dans des notes sous forme d’éléments de document comme des notes repliables ou des plans, et de les utiliser pour préparer des argumentations plus complexes. Cela rend la lecture active beaucoup plus facile
    Pour l’organisation des articles, j’aimerais trouver de meilleures méthodes ; sur le plan méthodologique, classer les livres par période, école de pensée et point de vue aide beaucoup
  • evince a ajouté récemment des fonctionnalités dont il m’est devenu difficile de me passer. La plus importante affiche, quand on survole un lien interne dans un PDF, un petit aperçu de l’endroit vers lequel pointe ce lien
    Dans un long document, si l’auteur écrit « cela découle du théorème 3.3 » et que le PDF est assez récent pour que « théorème 3.3 » soit un lien interne, on peut le survoler pour revoir immédiatement l’énoncé
  • J’utilise une combinaison de Zotero, de PDF/liens locaux avec une structure de dossiers, et de SumatraPDF. Pour chaque recherche bibliographique, je crée un dossier daté et nommé, par exemple 2024-03-21_Quantum_Entanglement
    On peut ajouter un fichier dans Zotero sous forme de lien avec CTRL-SHIFT-DRAG : #77. On peut organiser les choses dans Zotero, mais ce n’est pas obligatoire, et un même fichier peut être lié dans plusieurs dossiers Zotero. Je synchronise le dossier bibliographique et la base de données Zotero vers un emplacement de sauvegarde avec Nextcloud
    Dans Zotero, je désactive la synchronisation, je règle « Base directory » sur mon dossier bibliographique local et « PDF View » sur « System default ». En passant recursiveCollections à True, on obtient une recherche rapide récursive dans les dossiers, et CTRL-Shift-C copie les références dans le presse-papiers
    Pour le thème sombre, j’utilise https://github.com/Rosmaninho/Zotero-Dark-Theme ; je crée un dossier chrome dans XXXXXXXX.default sous %AppData%\Zotero\Zotero\Profiles\, j’y place userChrome.css, puis je lance Zotero
    Comme extensions, j’utilise zotero-pdfkit https://github.com/sharpevo/zotero-pdfkit/ pour aider à choisir la pièce jointe PDF par défaut, ZoteroDuplicatesMerger https://github.com/frangoud/ZoteroDuplicatesMerger pour faciliter la fusion des doublons, zotero-folder-import https://github.com/retorquere/zotero-folder-import pour importer en masse des PDF depuis un dossier, et zotero-tag https://github.com/windingwind/zotero-tag pour attribuer des notes aux éléments
    Côté outils PDF, j’utilise qpdf pour supprimer les mots de passe, déverrouiller et convertir, installé sous WSL avec apt-get install qpdf. La suppression du mot de passe se fait avec qpdf --decrypt --password="" input.pdf output.pdf
    SumatraPDF est vraiment rapide pour consulter des PDF et ajouter des annotations comme des surlignages et des commentaires ; le surlignage de texte se fait avec A, et l’enregistrement du fichier avec CTRL+SHIFT+S. C’est beaucoup plus rapide qu’Adobe Acrobat
    pdfplumber est un excellent package Python pour extraire des tableaux de PDF vers des pipelines de données, pratique à utiliser avec Jupyter Lab. PDF X-Change viewer s’installe avec choco install pdfxchangeviewer et je l’utilise pour l’OCR manuel de pages/PDF
  • Readwise Reader propose un lecteur PDF correct avec surlignages, notes et outils de lecture IA. Les documents s’organisent avec des tags
    C’est très récent et activement développé, mais la recherche académique n’étant pas son objectif principal, je doute qu’ils ajoutent de grosses fonctionnalités académiques comme la prise en charge des citations ou les backlinks. Il existe toutefois des backlinks Internet vers les articles lus
  • Peu de choses valent un simple fichier Google Docs dans lequel on prend des notes et ajoute des liens sci-hub. Les liens de téléchargement légaux expirent souvent avec le temps ou forcent le navigateur à télécharger le PDF
    Nous avons un Google Docs par projet de recherche, partagé avec les collaborateurs. Chacun a sa propre section dans le document, ce qui permet de partager facilement les informations entre nous

• La plupart des articles importants peuvent être lus avec des surlignages sur https://www.semanticscholar.org/. Le site propose PDF Semantic Reader et des fonctions d’aide au survol

• Lire un article demande une concentration profonde. Pour vraiment aller jusqu’au bout, il faut l’imprimer physiquement

  • Je recommande d’essayer de nouveaux appareils pour lire des articles. Si l’on a l’impression que le papier est un meilleur support, c’est souvent parce qu’on n’a pas essayé d’appareil plus confortable
    Le papier est clairement meilleur qu’un écran de 15 pouces pour plusieurs raisons, comme la taille et la posture de lecture, mais je me demande si vous avez essayé un écran plus grand (plus de 27 pouces), une grande tablette (A4 ou plus), ou le plus grand lecteur à encre électronique possible. Selon vos préférences, vous pourriez trouver quelque chose qui vous convient mieux que le papier

• Ça a l’air plutôt bien. Si tout est relié à un compte Gmail, je me demande s’ils vont implémenter la sauvegarde des annotations sur ces PDF, pour les stocker dans Drive ou ailleurs
  En plus, Chrome semble désormais utiliser cette extension par défaut pour le rendu de tous les PDF qu’il charge

• Ça a l’air bien, mais pouvez-vous imaginer Google se retirer soudainement de la base de données de documents/citations des chercheurs ?
  Je n’ai même pas envie d’imaginer devoir migrer toutes mes annotations et citations ailleurs quand ils finiront par débrancher la prise dans quelques années

  • Pourquoi ? Cet outil ne fait que parser des PDF, et les chercheurs n’ont pas vraiment à faire quoi que ce soit

• Je me demande s’il existe de bonnes recommandations de lecteur PDF local pour Windows. Je lis beaucoup d’articles ces derniers temps, et cliquer sur une citation dans Acrobat Reader est très frustrant
  Le document défile bien jusqu’à l’emplacement des références, mais il n’indique pas clairement l’entrée concernée dans la longue liste, comme dans la plupart des articles, et il ne semble pas y avoir de fonction retour qui marche, donc je dois faire défiler jusqu’à l’endroit où je lisais

  • J’utilise Sumatra PDF depuis plus de 10 ans sur Windows pour lire des articles et comme lecteur PDF par défaut. Quand on clique sur une citation, il va à la page des références, place l’article concerné tout en haut de l’écran, et on peut revenir avec Alt-leftarrow
  • Sioyek est un lecteur PDF conçu précisément pour lire des articles de recherche et des manuels : https://github.com/ahrm/sioyek
  • Le lecteur Zotero V7 est excellent. Il est basé sur pdfjs, le lecteur PDF de Mozilla, et ajoute de bonnes fonctions comme les annotations et le mode sombre
  • Utilise Okular. Tu n’as pas besoin du reste de KDE, il existe un installateur Windows et, à ma connaissance, il est aussi disponible sur le Windows Store
  • Si la vitesse est la priorité absolue, SumatraPDF est un bon choix
    Si tu as besoin de plus de fonctionnalités et que tu aimes les annotations, les surlignages, les marque-pages, etc., DrawboardPDF est bien, surtout si tu es susceptible d’utiliser un stylet

• Je n’avais jamais vu autant de modes clair/sombre. Il y a Device Mode, Light Mode, Dark Mode et Night Mode
  Si j’ai bien compris, Device Mode suit le réglage actuel du navigateur/de l’appareil, Dark Mode assombrit seulement la barre latérale sans modifier le PDF, et Night Mode assombrit à la fois la barre latérale et le PDF. Je me demande pourquoi ils ont décidé d’avoir autant de modes

  • Appliquer automatiquement un mode sombre à un document donne souvent de mauvais résultats, surtout quand il y a des images. Mais certaines personnes aiment souffrir ou ont la flemme d’allumer la lumière, donc ils ont probablement créé un réglage séparé
    Cela dit, un seul interrupteur aurait sans doute été préférable à une séparation Dark Mode/Night Mode
  • J’ai déjà vu dans d’autres applis des configurations du type System, Light, Dark, “Very Dark” pour les appareils OLED, donc ce n’est pas complètement absurde

• C’est correct, mais Google Scholar avait récemment supprimé de ses pages HTML tous les liens comme cited by et related articles. C’est resté comme ça pendant environ deux mois avant que la fonctionnalité soit rétablie, et il est très probable qu’ils les suppriment à nouveau bientôt
  Google Scholar ne s’améliore pas, il empire. Les développeurs de Google semblent n’avoir aucune idée de ce à quoi ressemblent les ordinateurs des chercheurs ordinaires dans le monde. Ils développent selon les conditions qu’ils connaissent, mais ce n’est pas adapté à la réalité. Un lecteur PDF lent et coûteux en calcul, basé sur JavaScript, est une autre manifestation de cette ignorance

  • Tout à fait d’accord. Qu’ils ne m’affichent pas le PDF, qu’ils me laissent juste télécharger le fichier pour le lire avec zathura
  • En plus de ça, j’ai l’impression que la recherche Google Scholar s’est nettement dégradée depuis environ un an. Même en cherchant avec le nom de l’auteur et quelques mots-clés du titre de l’article, il arrive que même des articles ayant environ 5 000 citations n’apparaissent pas
  • Quelles devraient être les exigences matérielles de base pour qu’un lecteur PDF JavaScript ne soit pas lent ?
  • Un lecteur PDF JavaScript qu’ils contrôlent offre des possibilités de monétisation. Ils pourraient insérer une page de publicité plein écran Naturally Fun Arkansas au milieu d’un article de Nature. Vous ne voulez quand même pas que Scholar finisse comme Reader ?
  • Tu es sûr que c’est vraiment arrivé ? Je ne l’ai pas remarqué du tout. Quelqu’un d’autre peut confirmer ? Tu as peut-être installé une extension qui casse le HTML