La transplantation fécale pour l’autisme obtient des résultats positifs en essai clinique (2019)
(refractor.io)- Des chercheurs d’ASU rapportent qu’après avoir augmenté la diversité du microbiote intestinal grâce à une transplantation de microbiote fécal, les symptômes de l’autisme et les symptômes gastro-intestinaux se sont améliorés durablement
- Selon les critères du CDC américain, l’autisme concerne 1 enfant sur 59 ; ASU estime qu’environ 30 à 50 % des personnes autistes souffrent de graves problèmes gastro-intestinaux
- Dans une première étude de 2017, 18 enfants autistes ont reçu une transplantation quotidienne pendant 7 à 8 semaines après un nettoyage intestinal, et des améliorations de la sociabilité, de l’hyperactivité et de la communication ont été observées
- Lors du suivi à 2 ans, les symptômes de l’autisme observés par les médecins avaient diminué de 45 % par rapport au niveau initial, et la part des cas classés sévères est passée de 83 % à 17 %
- Le traitement est en cours de développement sous le nom de Microbiota Transplant Therapy, et une levée de fonds est en cours pour un vaste essai clinique de phase 3 en vue d’une approbation de la FDA
Contexte de la recherche et approche thérapeutique
- Les chercheurs d’ASU étudient la possibilité qu’une augmentation de la diversité du microbiote intestinal puisse atténuer à la fois les symptômes de l’autisme et les problèmes gastro-intestinaux
- Selon les critères du CDC américain, 1 enfant sur 59 né aux États-Unis reçoit un diagnostic d’autisme, et les chercheurs de l’Arizona State University estiment qu’environ 30 à 50 % des personnes autistes souffrent de graves troubles gastro-intestinaux comme la constipation, la diarrhée ou les douleurs abdominales
- Selon Rosa Krajmalnik-Brown, de nombreux enfants autistes ont des problèmes gastro-intestinaux, et certaines études montrent que ces enfants présentent aussi des symptômes liés à l’autisme plus sévères
- Le traitement des problèmes gastro-intestinaux peut, dans de nombreux cas, conduire à une amélioration du comportement
Première étude et résultats du suivi à 2 ans
- Dans la première étude de 2017, 18 enfants autistes ont reçu une transplantation quotidienne de microbiote fécal pendant 7 à 8 semaines après un nettoyage intestinal
- Avant le traitement, les enfants participants présentaient une diversité du microbiote intestinal bien plus faible que les enfants non autistes
- Après le traitement, les questionnaires évaluant la sociabilité, l’hyperactivité et la communication ont montré une amélioration du comportement, et l’effet initial s’est maintenu pendant 8 semaines
- Krajmalnik-Brown estime que les enfants autistes manquent de certaines bactéries bénéfiques importantes et disposent de moins d’options parmi les fonctions essentielles fournies par les bactéries intestinales que les enfants au développement typique
- Le suivi à 2 ans a montré non seulement que l’effet se maintenait, mais aussi qu’il s’était renforcé
- Selon les observations des médecins, les symptômes psychologiques de l’autisme avaient diminué de 24 % au bout de 8 semaines, et l’évaluation professionnelle réalisée 2 ans plus tard a montré une diminution de 45 % des symptômes de l’autisme par rapport au niveau initial
- Avant l’étude, 83 % des participants étaient classés comme atteints d’un autisme « sévère », mais 2 ans plus tard, cette part est tombée à 17 % ; 39 % étaient évalués comme légers ou modérés, et 44 % étaient passés sous le seuil de référence d’un ASD léger
- Krajmalnik-Brown a déclaré que l’équipe découvrait un lien fort entre le microbiote intestinal et les signaux transmis au cerveau, et que le fait que les enfants aillent encore mieux après 2 ans était surprenant
Développement clinique et phase de commercialisation
- La prochaine étape est un grand essai clinique contrôlé par placebo visant à valider les résultats et à obtenir l’approbation de la FDA
- Début 2022, Krajmalnik-Brown et ses collègues ont déposé un brevet sur une formulation bactérienne spécifique et créé une spin-off nommée Gut-Brain Axis Therapeutics
- Le traitement est appelé Microbiota Transplant Therapy (MTT), et des données initiales se sont ensuite révélées prometteuses dans un essai clinique de phase 2 contrôlé par placebo chez l’humain
- Selon l’explication des chercheurs d’ASU, dans une étude de phase 2 portant sur des adultes autistes, le groupe traité a montré davantage d’améliorations que le groupe placebo, tant sur le critère principal des symptômes de l’autisme que sur le critère secondaire du relevé quotidien des selles
- Dans l’évaluation Parent Global Impressions, à la fin de la part 2, le groupe traité a montré plus d’améliorations que le groupe placebo de la part 1 sur presque tous les symptômes, avec des améliorations statistiquement significatives pour les symptômes gastro-intestinaux, le langage réceptif et la moyenne globale des symptômes
- Des améliorations à la limite de la significativité ont aussi été observées pour les colères, l’auto-stimulation / les comportements répétitifs, ainsi que la cognition
- L’équipe de recherche cherche actuellement à financer le vaste essai clinique de phase 3 nécessaire à l’approbation finale de la FDA
Sources et documents associés
- Scientific Reports : étude clé de 2019
- Arizona State University : source de la recherche
- Microbiota Transplant for Adults with Autism by Prof. James Adams
1 commentaires
Avis Hacker News
Parmi les enfants autistes, beaucoup ont une alimentation extrêmement limitée
Dans un cas vu par une connaissance généticienne, un enfant autiste présentait d’horribles plaies chroniques spontanées aux gencives et à la peau, au point qu’on a demandé un test génétique ; il s’est avéré qu’il s’agissait en fait d’un scorbut, parce qu’il ne mangeait depuis 3 à 4 ans que des Wheat Thins non enrichis en vitamine C
Une alimentation monotone semble très susceptible de favoriser sélectivement certaines espèces bactériennes adaptées à ce régime et d’en réduire d’autres, ce qui pourrait fortement déformer la composition du microbiote intestinal. Si l’alimentation a ensuite changé ou s’est diversifiée, une greffe fécale pourrait rétablir des espèces bactériennes capables de survivre à nouveau et apporter des bénéfices durables
J’aimerais voir des résultats qui distinguent l’effet de la composition du régime, du microbiote intestinal, de la génétique et de la gravité des symptômes de l’autisme
Quand j’étais enfant, je n’ai mangé pendant plusieurs années que des Cheerios nature, et pour un ami proche, c’était les nuggets de poulet
Que cela puisse aggraver les symptômes, peut-être, mais l’idée que ce soit la cause me paraît très douteuse
Cette manière de reprendre et de mettre à jour en 2025, comme une « note de la rédaction », un article initialement paru en 2019 avec de nouvelles informations au 7 avril 2025 devrait être bien plus fréquente
C’est particulièrement nécessaire en journalisme scientifique, mais pas uniquement. Nous manquons trop d’une vision de long terme tournée non seulement vers l’avenir, mais aussi vers le passé
En pratique, cela ressemble plutôt à une réaction à des sollicitations de communication d’entreprise, et on voit d’ailleurs qu’il n’y a pas de lien vers de nouveaux articles scientifiques. Il n’y a que des citations de l’entreprise, donc cela ressemble moins à une mise à jour de recherche qu’à une répétition de matériel promotionnel
Le contexte apparaît davantage quand on lit les documents de l’entreprise qui cherche à commercialiser cette formulation : un petit essai de phase 2 est en cours, mais les résultats ne semblent pas avoir été entièrement publiés. Ils donnent l’impression de pousser la communication sur la base de premiers résultats positifs avant toute divulgation complète
Quand une entreprise agit ainsi avant de publier l’ensemble des résultats, c’est souvent un peu suspect : cela ressemble à une communication précipitée calée sur le moment le plus propice pour attirer l’attention des investisseurs. Si le meilleur moment pour faire de la promo est avant la publication complète, ce n’est pas le signe que les résultats sont excellents
Le journalisme scientifique gagnerait peut-être à adopter plutôt un modèle wiki, avec un article par sujet, enrichi au fil des nouvelles informations ou données confirmées, et auquel les personnes intéressées pourraient s’abonner pour suivre les mises à jour
À condition qu’il soit géré par les bonnes personnes, un wiki est bien plus robuste pour la maintenance sur le long terme. À l’inverse, les articles de type « publication de presse » finissent par vieillir, et il est souvent difficile de savoir quand un vieux texte a réellement été mis à jour
L’enregistrement de l’essai clinique semble être celui-ci : https://clinicaltrials.gov/study/NCT03408886?tab=results
Les résultats ont été soumis, mais sont indiqués comme n’ayant pas encore passé le contrôle qualité
N=60 avec un groupe placebo, donc mieux que la première étude avec N=18 et sans placebo
Il y a eu bien trop de petits essais montrant des résultats spectaculaires sur l’autisme qui ont échoué à être reproduits dans des essais plus vastes et mieux contrôlés pour s’enthousiasmer à ce stade
Le schéma typique, c’est un premier petit essai ouvert avec des résultats incroyablement bons, puis un essai suivant contre placebo avec une amélioration à peine légère, puis un troisième essai qui devient un jeu consistant à garder l’étude suffisamment petite pour pouvoir p-hacker un résultat que la FDA acceptera peut-être
L’enregistrement correct est probablement celui-ci : https://clinicaltrials.gov/study/NCT02504554
Le rapport de suivi de 2019 est ici : https://www.nature.com/articles/s41598-019-42183-0
Cela dit, le raisonnement de fond reste probablement valable. Il n’y avait pas de groupe placebo, et beaucoup de choses peuvent changer quand on suit pendant 2 ans des participants âgés de 7 à 17 ans. Ils ont pu recevoir de l’orthophonie, ou simplement apprendre davantage de stratégies d’adaptation en grandissant
Le rapport de suivi de 2019 dit aussi que 12 participants sur 18 ont, en parallèle, modifié leur régime alimentaire et leur traitement. Les chercheurs disent que ces ajustements étaient mineurs, mais cela reste du bruit, sans compter les changements sociaux ou environnementaux non rapportés
Le résultat intéressant qui pourrait être reproduit dans un essai randomisé contrôlé plus large est probablement l’amélioration du microbiote intestinal. Là, il semble y avoir un mécanisme plus direct, mais ce n’est qu’une intuition
C’est un bon exemple de la facilité avec laquelle on peut être induit en erreur en ne lisant que le titre, même si le titre n’est pas volontairement trompeur ou putaclic
Si on assemble « diminution des symptômes de l’autisme », « réalité éprouvante des troubles gastro-intestinaux chroniques », « augmentation de la diversité microbienne » et « traiter les problèmes gastro-intestinaux améliore le comportement », mon interprétation est la suivante
Les problèmes gastro-intestinaux sont une comorbidité fréquente de l’autisme, et les corriger permet à la personne autiste de masker plus facilement et plus efficacement
Les problèmes gastro-intestinaux génèrent beaucoup de stress, et le masking aussi ; il est donc logique qu’un autiste stressé ait plus de mal à masker
Le masking fait paraître de nombreux « symptômes » de l’autisme moins visibles, mais au prix de risques comme le stress ou la dépression, et presque toutes les sociétés conditionnent inconsciemment les enfants à masker en permanence leur autisme
L’implication la plus gênante, c’est qu’aux États-Unis et en Arizona, les enfants ayant des problèmes gastro-intestinaux ne reçoivent souvent pas de traitement approprié. Sinon, il aurait été impossible d’obtenir un échantillon d’enfants autistes sans un fort biais de sélection
Traiter les problèmes gastro-intestinaux ne devrait pas être un moyen de réduire les symptômes de l’autisme ; c’est quelque chose qu’il faut faire de toute façon. Même indépendamment de la qualité de vie, les laisser durer des années entraîne souvent des problèmes à long terme bien plus graves
J’ai été un peu surpris de voir des chercheurs universitaires utiliser le temps et l’argent de l’université pour prolonger des recherches publiques existantes, faire une découverte, la verrouiller par brevet, puis créer une entreprise à but lucratif
Pardonnez mon ignorance, mais je me demande si c’est habituellement ainsi que cela se passe. Je me demande aussi où se situe le bénéfice pour les personnes potentiellement concernées
Je comprends qu’il faille un certain niveau de commercialisation et que l’université reste probablement impliquée, mais cela me met mal à l’aise
Arizona State University semble faire ce genre de choses via Skysong Innovations : https://skysonginnovations.com/startups/list/
Il est aussi intéressant de voir qu’ils ont reçu beaucoup d’argent de plus de 100 familles ayant un enfant autiste : https://skysonginnovations.com/startups/list/
Même quand une recherche débouche sur un produit commercialisable, cela sort très largement du périmètre de l’université
Il faut aussi garder à l’esprit que, dans la plupart des disciplines scientifiques, les recherches ne mènent généralement pas à des produits commercialisables. C’est le cas par exemple des sciences sociales, de l’archéologie ou de la géographie
La part que prend l’université dans un spin-off varie d’un établissement à l’autre
Cela a joué un rôle non négligeable dans l’essor de Northwestern ces 10 à 20 dernières années
Les universités aiment cela et l’encouragent. Les grandes universités disposent d’organismes de type bureau de « transfert de technologie » pour aider les chercheurs à le faire
Avant l’étude, 83 % des participants étaient considérés comme autistes « sévères » ; deux ans plus tard, ils n’étaient plus que 17 %, 39 % étaient classés comme légers ou modérés, et, fait surprenant, 44 % passaient sous le seuil d’un TSA léger
Si c’est vrai, c’est vraiment énorme
J’ai du mal à croire que le microbiote intestinal puisse avoir un effet si important sur le cerveau qu’il rendrait quelqu’un à la fois incapable de lire les signaux sociaux mais doté d’une mémoire extraordinaire
Cela dit, j’ai aussi connu des personnes non « sur le spectre » avec une mémoire impressionnante, comme ce professeur qui savait à quelle page se trouvait telle phrase dans tel livre. Peut-être que, chez des personnes de niveau Asperger, ce type de capacité s’accompagne simplement des difficultés propres à l’autisme
Il faut malgré tout rester prudent avec ce genre de résultats. Beaucoup d’autistes sont très sélectifs dans leur alimentation, et certains ont aussi des problèmes de motilité intestinale
Cela peut également affecter le microbiote intestinal. Il est plausible que cela aide certaines personnes, mais l’autisme est un état très hétérogène, généralement avec une forte prédisposition génétique ; il ne faut donc pas généraliser
Dans l’ensemble, cela ne ressemble pas à un remède
En gros, ils ont d’abord vidé l’intestin avec des antibiotiques avant de commencer le traitement, puis ont observé une amélioration
Il est possible que les problèmes gastro-intestinaux augmentent l’irritabilité et rendent les symptômes mesurés de l’autisme plus agressifs, mais cela paraît très prometteur pour les familles
Certains travaux suggèrent que des bactéries intestinales peuvent induire la dépression ; or, quand on est déprimé, on consomme davantage d’aliments ultra-transformés très caloriques, ce qui avantage ces bactéries. Il suffit de penser aux crises de glace quand on va mal
Il n’est pas non plus absurde d’imaginer que des bactéries intestinales optimisées pour certains aliments aient évolué pour pousser leur hôte à ne manger que ceux-là. Cela leur donne aussi l’avantage collatéral d’affamer d’autres microbes moins adaptés à ces aliments et de réduire ainsi la concurrence
En biologie surtout, les choses ne se divisent pas toujours simplement entre cause et conséquence
J’ai suivi un régime carnivore strict pendant 4 ans, puis j’ai développé une constipation chronique sévère
Le simple fait de réintroduire des fibres n’a pas suffi, mais ajouter des aliments fermentés comme le kimchi a amélioré la situation
Je me demande si les aliments fermentés pourraient restaurer le microbiote intestinal d’une manière plus naturelle qu’une greffe fécale, et peut-être même aider dans le traitement de l’autisme. Les études ne sont pas concluantes, mais cette histoire donne envie d’explorer davantage
Ce qu’on comprend encore mal, c’est pourquoi certaines personnes ne reçoivent pas ce microbiote au départ, ou pourquoi elles le perdent ensuite. Il existe aussi des techniques pour transmettre pendant l’accouchement le microbiote maternel en cas de naissance non vaginale
Même après une greffe, chez certaines personnes, ces microbes ne restent pas durablement. Ici, je parle des gens en général, pas spécifiquement des personnes autistes
Manger une grande variété d’aliments aide beaucoup, tout comme éviter les aliments ultra-transformés. Les aliments ultra-transformés n’atteignent pas l’extrémité de l’intestin
Les aliments fermentés, ainsi que les prébiotiques et probiotiques, peuvent aussi aider
Mais chez certaines personnes, même tout cela ne suffit pas à restaurer leur microbiote
Est-ce que la constipation est apparue dès le début du régime carnivore strict, ou seulement au bout de 4 ans ?
Et j’aimerais bien voir la liste complète de tout ce que vous mangiez dans ce régime strict, y compris le sel, l’eau, etc. J’imagine que ce ne serait pas une longue liste
C’est anecdotique, mais mes difficultés cognitives réagissent plutôt positivement aux compléments souvent recommandés pour des troubles cognitifs comme le TDAH, en particulier la vitamine D3 et les oméga 3 ; le zinc et le magnésium, en revanche, n’ont pas aidé
J’ai un SII, qui peut mener à des carences nutritionnelles, et j’ai aussi passé le premier pré-dépistage d’une évaluation TDAH ; je devrais donc bientôt être évalué. Je soupçonne aussi un autisme, mais pour l’instant, le rapport coût/bénéfice de l’évaluation ne me paraît pas très convaincant
Un microbiote différent pourrait simplement être une autre manière de corriger des carences nutritionnelles
Qu’est-ce qui est le plus plausible ? Qu’on ait guéri en 2 ans un autisme sévère avec faibles capacités fonctionnelles, ou qu’on ait mal classé les enfants et qu’en mûrissant ils soient sortis du cadre diagnostique ?
Dans l’étude de phase 2 sur des adultes autistes, le groupe traité aurait davantage progressé que le placebo sur le critère principal, les symptômes de l’autisme, ainsi que sur un critère secondaire, le suivi quotidien du transit intestinal
L’alimentation moderne très transformée tend à endommager le microbiote intestinal et à en réduire la diversité. Même l’augmentation de la fréquence des césariennes semble diminuer cette diversité, avec en aval toute une série de maladies
En même temps, le microbiote intestinal est extraordinairement complexe à étudier
C’est pourquoi ces résultats pourraient être plausibles. Il est difficile de trancher immédiatement comme vous le proposez