La FDA autorise le premier test sanguin capable de détecter des prédispositions héréditaires à des dizaines de cancers
(insideprecisionmedicine.com)- La FDA a autorisé Invitae Common Hereditary Cancers Panel, ouvrant la voie à l’évaluation, à partir d’un prélèvement sanguin, de variations de l’ADN dans 47 gènes associées à un risque accru de cancer
- Cette autorisation de commercialisation de novo crée une nouvelle classification réglementaire, et les dispositifs ultérieurs du même type pourront suivre la procédure préalable à la mise sur le marché FDA 510(k)
- La FDA a défini des contrôles spéciaux incluant l’étiquetage et les essais de performance, avec des exigences élevées de concordance positive et négative pour la précision du signalement des principales variations
- Ce test sur prescription est réalisé à partir d’un prélèvement effectué sur le lieu de soins puis analysé en laboratoire, et l’interprétation des variations combine littérature scientifique, bases de données publiques, programmes de prédiction et base de données interne de curation d’Invitae
- Les faux positifs, faux négatifs et les erreurs d’interprétation des résultats constituent les principaux risques, les faux négatifs pouvant notamment priver les patients d’une surveillance ou d’une prise en charge clinique nécessaires
Autorisation de la FDA et périmètre du test
- La FDA a autorisé le premier test sanguin pouvant aider à identifier des centaines de variations héréditaires potentiellement liées au cancer
- Invitae Common Hereditary Cancers Panel recherche, dans un échantillon sanguin, des variations de l’ADN dans 47 gènes associées à un risque accru de développer certains cancers
- Il permet d’évaluer plusieurs gènes en un seul test et utilise le séquençage de nouvelle génération (NGS)
- Jeff Shuren, du Center for Devices and Radiological Health de la FDA, estime que la sensibilité et la rapidité du NGS contribuent à fournir des informations utiles sur les variations génétiques
Nouvelle classification réglementaire et exigences de performance
- La FDA a accordé à ce test une autorisation de commercialisation de novo, créant une nouvelle classification réglementaire
- Les dispositifs ultérieurs du même type pourront obtenir une autorisation de commercialisation via la procédure préalable à la mise sur le marché 510(k) de la FDA
- Avec cette autorisation De Novo, la FDA a également établi des contrôles spéciaux définissant les exigences relatives à l’étiquetage et aux essais de performance
- La précision du signalement des substitutions, insertions/suppressions et variations du nombre de copies doit présenter un taux de concordance positive ≥99,0 % par rapport à une méthode orthogonale validée
- Le taux de concordance négative pour ces mêmes éléments doit être de ≥99,9 %
Demande en tests de cancer héréditaire et écart d’utilisation
- Selon les CDC, il existe plus de 100 types de cancer, et le cancer est la deuxième cause majeure de décès aux États-Unis après les maladies cardiaques
- Le nombre de variations héréditaires liées au cancer identifiées et les tests associés augmentent régulièrement
- Pourtant, l’utilisation réelle de ces tests pour détecter ces variations n’augmente pas fortement
Parcours de soins et retour des patients
- Une équipe de recherche de l’University of Vermont Medical Center collabore avec Invitae pour tester précocement les patients atteints d’un cancer avancé et proposer un conseil génétique lorsqu’une variation génétique pathogène est confirmée
- Une présentation à l’ASCO a évalué la satisfaction des patients et des soignants vis-à-vis d’une procédure de test simplifiée
- Plus de 94 % des patients ont évalué positivement le fait d’avoir passé le test lors d’un rendez-vous de soins habituel
- 82 % des participants se sont dits confiants dans leur compréhension des résultats du test
Mode de prescription et interprétation des variations
- Le test sur prescription d’Invitae repose sur un prélèvement réalisé sur le lieu de soins, par exemple dans le cabinet du médecin, puis envoyé au laboratoire
- L’interprétation clinique des variations s’appuie sur les éléments suivants
- littérature scientifique publiée
- bases de données publiques
- programmes de prédiction
- base de données interne d’Invitae pour la curation des variations
- Les critères d’interprétation des variations reposent sur des référentiels définis par des organismes professionnels ou des commissions de certification
Principaux gènes et maladies associées
- Parmi les gènes cliniquement importants identifiés par le test figurent BRCA1 et BRCA2, associés au syndrome héréditaire du cancer du sein et de l’ovaire
- Les gènes associés au syndrome de Lynch comprennent MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM
- CDH1 est principalement associé au cancer gastrique diffus héréditaire et au cancer du sein lobulaire
- STK11 est associé au syndrome de Peutz-Jeghers
Risques du test et points de vigilance clinique
- Les principaux risques associés à ce test sont les faux positifs, les faux négatifs et les erreurs d’interprétation des résultats
- Un résultat faux négatif peut procurer au patient un faux sentiment de sécurité
- Les patients recevant un faux négatif risquent de ne pas bénéficier d’une surveillance adaptée ni d’une prise en charge clinique appropriée
1 commentaires
Avis sur Hacker News
Excellente nouvelle. J’ai fait le test Invitae, à la suite de cet article : https://jakeseliger.com/2023/07/22/i-am-dying-of-squamous-ce...
D’après ce que je comprends, obtenir une approbation de la FDA signifie que le test peut être pris en charge par l’assurance
D’après des oncologues médicaux, les analyses sanguines sont actuellement presque un Far West dans le domaine du profilage du cancer. L’approbation de tests sanguins comme CARIS https://www.carislifesciences.com/products-and-services/mole... ou Guardant360 https://guardanthealth.com/products/tests-for-patients-with-... semble importante du point de vue de l’assurance
Il faudra probablement encore environ 2 ans, voire plus, avant de pouvoir demander une prescription à son médecin et obtenir un remboursement par l’assurance
Cela dit, il est désormais légal de faire connaître le produit et, en théorie, on peut le payer soi-même
La prise en charge est essentiellement un jeu d’attente entre le fabricant et l’assureur. Si l’on a assez de capital pour tenir et nouer des relations avec les dirigeants, on peut obtenir une couverture ; sinon, ce n’est pas simple
Pour clarifier, ce test recherche 47 gènes associés à un risque accru de cancer. Contrairement à des tests sanguins comme Galleri, il ne dit pas si vous avez actuellement un cancer
0 : https://www.galleri.com/
Leur point commun est qu’il s’agit de tests CLIA, et non de tests ayant reçu une approbation de la FDA
Le test Invitae de l’article a reçu l’approbation de la FDA, ce qui n’est vraiment pas un petit accomplissement. C’est un processus difficile, et cela renforce beaucoup la crédibilité technique
Si Grail avait pu faire approuver son test par la FDA, elle l’aurait déjà fait
On dirait que cela pourrait simplement générer de l’anxiété
Ce qui m’inquiète le plus avec ce genre de test, c’est ce que le fait de connaître son profil de risque pourrait signifier à l’avenir pour sa capacité à souscrire ou conserver une assurance santé, ou pour ses primes. Comme je vis aux Pays-Bas, ce n’est peut-être pas un gros problème, mais aux États-Unis cela pourrait être différent, et nul ne sait de quoi l’avenir sera fait
Cela me donne moins envie de passer ce type de test, voire pas du tout
https://www.genome.gov/about-genomics/policy-issues/Genetic-...
Le GINA mentionné dans le commentaire frère est aussi pertinent ici, mais je n’arrivais plus à me souvenir du nom
À un niveau technologique plus modeste, si une personne présente une mutation tumorale à fort impact, elle-même et son médecin seront plus vigilants quant à la surveillance ou au dépistage de certains cancers
Il faut garder à l’esprit que plus un cancer est détecté tôt, plus le pronostic s’améliore de façon spectaculaire
Invitae fait vraiment du bon travail en commercialisant des tests de diagnostic génétique de grande qualité et en les proposant directement aux consommateurs à un prix raisonnable. Nous l’avons utilisé pour un dépistage prénatal : ils proposaient à un prix raisonnable un test d’ADN circulant qui n’est généralement couvert par l’assurance que pour les grossesses à âge maternel avancé
J’aimerais que les assureurs couvrent ces tests afin qu’Invitae soit mieux rémunérée pour son travail, mais le système de santé américain est vraiment étrange
L’un des problèmes de ces tests génétiques, en particulier dans des domaines comme la pharmacogénomique, est que les médecins ne les ont pas encore intégrés à la prise en charge ni à leurs workflows. Résultat : même quand le test fournit des informations exploitables, ils ne savent pas toujours quoi en faire concrètement
J’ai déjà passé un test Invitae dans le cadre d’une FIV. Franchement, si c’est possible, ne pas vérifier qu’il n’existe pas d’incompatibilité génétique suffisamment grave entre soi et son partenaire pour devoir passer par une FIV me semble presque contraire à l’éthique
C’est vrai qu’il faut jouer avec les cartes qu’on a en main
Mais c’est une bonne chose de connaître ses probabilités
Ce qui sera encore mieux, c’est le jour où nous pourrons traiter le cancer et piocher de nouvelles cartes
Lien direct vers l’annonce de la FDA :
https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/fda-gran...
C’est une excellente nouvelle, mais ces gènes ne sont-ils pas déjà identifiés par des tests ADN bon marché comme 23andMe ? Il me semble qu’ils testent bien les variants de BRCA1 et BRCA2.
Ou alors je me demande si ce test couvre beaucoup plus de variants.
En outre, Invitae consacre énormément d’efforts à déterminer si certains variants — y compris des variants qui seront très fréquents chez tout le monde — sont bénins ou pathogènes.
Invitae a notamment soutenu que l’approche de type 23andMe passerait à côté de nombreux variants importants, surtout dans certains groupes sous-représentés [1].
Décharge : je suis un ancien employé d’Invitae et je détiens encore des actions, autrefois assez nombreuses. Toutes les opinions exprimées sont personnelles.
[0] Rare à l’échelle de la population. En première approximation, chaque personne possède 0, 1 ou 2 copies d’un polymorphisme donné.
[1] https://www.biospace.com/article/invitae-challenges-accuracy...
Pendant un temps, seule Myriad pouvait effectuer les tests BRCA1/2, car l’entreprise détenait des brevets sur les séquences génétiques elles-mêmes. L’affaire est allée jusqu’à la Cour suprême, qui a jugé que les séquences de gènes humains ne pouvaient pas être brevetées.
Invitae a fait du bon travail pour élargir les tests génétiques et les rendre plus accessibles, mais l’entreprise a choisi une stratégie de forte croissance risquée et en a payé le prix lorsque le contexte économique a changé.
J’espère que ces efforts ne disparaîtront pas, même si l’entreprise ne survit pas à long terme sous sa forme actuelle.
Le test Galleri de Grail détecte plus de 40 types de cancer à partir d’une prise de sang, certains à un stade aussi précoce que le stade 1.
Il coûte environ 1 000 dollars par test.